Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17,24■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,24■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17,24■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17,23■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Twist1P26687 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17,22■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17,21■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,21■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17,21■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,21■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17,2■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,2■□□□□ 0,34
Twist1P26687 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17,19■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,19■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17,19■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,18■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17,18■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17,17■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,17■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Twist1P26687 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Twist1P26687 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17,16■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,16■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,15■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,15■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Twist1P26687 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,34
Twist1P26687 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17,14■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17,14■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17,14■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
Twist1P26687 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17,14■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,14■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,13■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17,13■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17,12■□□□□ 0,33
Twist1P26687 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17,12■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,12■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms