Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kcna3P16390 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcna3P16390 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kcna3P16390 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133 ms