Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30aP15533 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30aP15533 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim30aP15533 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim30aP15533 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim30aP15533 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30aP15533 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30aP15533 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30aP15533 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30aP15533 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30aP15533 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms