Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrphP15331 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrphP15331 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrphP15331 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrphP15331 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrphP15331 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrphP15331 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrphP15331 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrphP15331 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrphP15331 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrphP15331 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrphP15331 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrphP15331 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrphP15331 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrphP15331 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrphP15331 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrphP15331 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrphP15331 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrphP15331 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrphP15331 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrphP15331 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrphP15331 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrphP15331 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrphP15331 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PrphP15331 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrphP15331 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrphP15331 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrphP15331 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrphP15331 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrphP15331 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrphP15331 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrphP15331 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrphP15331 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrphP15331 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrphP15331 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrphP15331 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrphP15331 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrphP15331 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrphP15331 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrphP15331 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrphP15331 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrphP15331 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrphP15331 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrphP15331 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrphP15331 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrphP15331 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrphP15331 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrphP15331 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrphP15331 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrphP15331 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrphP15331 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrphP15331 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PrphP15331 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrphP15331 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrphP15331 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrphP15331 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrphP15331 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PrphP15331 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrphP15331 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PrphP15331 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrphP15331 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrphP15331 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrphP15331 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrphP15331 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrphP15331 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrphP15331 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrphP15331 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrphP15331 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrphP15331 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrphP15331 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrphP15331 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrphP15331 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrphP15331 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrphP15331 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrphP15331 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrphP15331 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrphP15331 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrphP15331 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrphP15331 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrphP15331 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrphP15331 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PrphP15331 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrphP15331 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrphP15331 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrphP15331 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrphP15331 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrphP15331 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrphP15331 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrphP15331 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrphP15331 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrphP15331 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrphP15331 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrphP15331 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrphP15331 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrphP15331 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PrphP15331 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PrphP15331 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrphP15331 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrphP15331 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrphP15331 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms