Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp54P14576 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srp54P14576 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp54P14576 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp54P14576 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp54P14576 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54P14576 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54P14576 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp54P14576 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp54P14576 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp54P14576 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54P14576 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
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