Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scd1P13516 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scd1P13516 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scd1P13516 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Scd1P13516 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scd1P13516 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scd1P13516 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scd1P13516 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scd1P13516 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scd1P13516 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scd1P13516 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scd1P13516 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scd1P13516 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scd1P13516 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd1P13516 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd1P13516 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scd1P13516 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scd1P13516 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scd1P13516 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scd1P13516 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scd1P13516 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scd1P13516 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scd1P13516 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Scd1P13516 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scd1P13516 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scd1P13516 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scd1P13516 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scd1P13516 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scd1P13516 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms