Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calb1P12658 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calb1P12658 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calb1P12658 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calb1P12658 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calb1P12658 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calb1P12658 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calb1P12658 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calb1P12658 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Calb1P12658 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb1P12658 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms