Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RaraP11416 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RaraP11416 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RaraP11416 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RaraP11416 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RaraP11416 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RaraP11416 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RaraP11416 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RaraP11416 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RaraP11416 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RaraP11416 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RaraP11416 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RaraP11416 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RaraP11416 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RaraP11416 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RaraP11416 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RaraP11416 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RaraP11416 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RaraP11416 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RaraP11416 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RaraP11416 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RaraP11416 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RaraP11416 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RaraP11416 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RaraP11416 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RaraP11416 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RaraP11416 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RaraP11416 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RaraP11416 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RaraP11416 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RaraP11416 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RaraP11416 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RaraP11416 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RaraP11416 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RaraP11416 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RaraP11416 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RaraP11416 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RaraP11416 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RaraP11416 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RaraP11416 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RaraP11416 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RaraP11416 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RaraP11416 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RaraP11416 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RaraP11416 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RaraP11416 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RaraP11416 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RaraP11416 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RaraP11416 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RaraP11416 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RaraP11416 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RaraP11416 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RaraP11416 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RaraP11416 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RaraP11416 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RaraP11416 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RaraP11416 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RaraP11416 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RaraP11416 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RaraP11416 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RaraP11416 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RaraP11416 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RaraP11416 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RaraP11416 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RaraP11416 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RaraP11416 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RaraP11416 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RaraP11416 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RaraP11416 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RaraP11416 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RaraP11416 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RaraP11416 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RaraP11416 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RaraP11416 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RaraP11416 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RaraP11416 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RaraP11416 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RaraP11416 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RaraP11416 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RaraP11416 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RaraP11416 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RaraP11416 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RaraP11416 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RaraP11416 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RaraP11416 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RaraP11416 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RaraP11416 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RaraP11416 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RaraP11416 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RaraP11416 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RaraP11416 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RaraP11416 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RaraP11416 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RaraP11416 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RaraP11416 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RaraP11416 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RaraP11416 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RaraP11416 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RaraP11416 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RaraP11416 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms