Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col3a1P08121 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col3a1P08121 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col3a1P08121 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col3a1P08121 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Col3a1P08121 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col3a1P08121 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col3a1P08121 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col3a1P08121 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col3a1P08121 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col3a1P08121 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col3a1P08121 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms