Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtrP07309 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtrP07309 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtrP07309 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtrP07309 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtrP07309 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TtrP07309 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TtrP07309 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtrP07309 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
TtrP07309 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtrP07309 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtrP07309 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtrP07309 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtrP07309 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TtrP07309 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtrP07309 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtrP07309 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtrP07309 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtrP07309 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtrP07309 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtrP07309 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtrP07309 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtrP07309 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtrP07309 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtrP07309 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms