Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01680 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01680 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01680 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01680 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01680 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01680 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01680 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01680 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01680 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01680 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01680 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01680 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01680 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01680 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01680 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01680 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01680 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01680 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01680 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01680 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01680 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01680 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01680 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01680 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01680 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01680 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01680 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P01680 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01680 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01680 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01680 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01680 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01680 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01680 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01680 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01680 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01680 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01680 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01680 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01680 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01680 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01680 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01680 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01680 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
P01680 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01680 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01680 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01680 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01680 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01680 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01680 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01680 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01680 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01680 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01680 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01680 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01680 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01680 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01680 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01680 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01680 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01680 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01680 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01680 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01680 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01680 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01680 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01680 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01680 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01680 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01680 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01680 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01680 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01680 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01680 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01680 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01680 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
P01680 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01680 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01680 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01680 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01680 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01680 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P01680 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P01680 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01680 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01680 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01680 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01680 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01680 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01680 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01680 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
P01680 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
P01680 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01680 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01680 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01680 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01680 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01680 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms