Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01664 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01664 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01664 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01664 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
P01664 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
P01664 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01664 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01664 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01664 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01664 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01664 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01664 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01664 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
P01664 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01664 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01664 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01664 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01664 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
P01664 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01664 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01664 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
P01664 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01664 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01664 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
P01664 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01664 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01664 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01664 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01664 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01664 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01664 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01664 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01664 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01664 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01664 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01664 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01664 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01664 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
P01664 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01664 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
P01664 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01664 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
P01664 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
P01664 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01664 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01664 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01664 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01664 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01664 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01664 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01664 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01664 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01664 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01664 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01664 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01664 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01664 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01664 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01664 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01664 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01664 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01664 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01664 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01664 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
P01664 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
P01664 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01664 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01664 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01664 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01664 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01664 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01664 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01664 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01664 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01664 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01664 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01664 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01664 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01664 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01664 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01664 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01664 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01664 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01664 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01664 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01664 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01664 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01664 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01664 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01664 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01664 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01664 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01664 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01664 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01664 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01664 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P01664 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01664 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01664 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms