Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CpdO89001 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CpdO89001 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CpdO89001 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CpdO89001 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CpdO89001 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CpdO89001 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CpdO89001 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CpdO89001 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CpdO89001 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CpdO89001 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CpdO89001 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CpdO89001 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CpdO89001 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CpdO89001 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CpdO89001 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CpdO89001 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CpdO89001 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CpdO89001 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CpdO89001 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CpdO89001 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CpdO89001 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CpdO89001 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CpdO89001 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CpdO89001 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CpdO89001 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CpdO89001 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CpdO89001 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CpdO89001 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CpdO89001 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CpdO89001 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CpdO89001 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CpdO89001 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CpdO89001 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CpdO89001 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CpdO89001 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CpdO89001 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CpdO89001 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CpdO89001 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CpdO89001 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CpdO89001 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CpdO89001 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CpdO89001 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CpdO89001 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CpdO89001 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CpdO89001 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CpdO89001 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CpdO89001 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CpdO89001 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CpdO89001 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CpdO89001 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CpdO89001 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CpdO89001 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CpdO89001 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CpdO89001 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CpdO89001 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CpdO89001 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CpdO89001 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CpdO89001 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CpdO89001 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CpdO89001 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CpdO89001 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CpdO89001 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CpdO89001 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CpdO89001 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CpdO89001 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CpdO89001 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CpdO89001 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CpdO89001 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CpdO89001 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CpdO89001 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CpdO89001 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CpdO89001 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CpdO89001 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CpdO89001 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CpdO89001 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CpdO89001 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CpdO89001 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CpdO89001 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CpdO89001 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CpdO89001 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CpdO89001 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CpdO89001 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CpdO89001 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CpdO89001 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CpdO89001 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CpdO89001 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CpdO89001 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CpdO89001 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CpdO89001 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CpdO89001 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CpdO89001 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CpdO89001 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CpdO89001 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CpdO89001 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CpdO89001 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CpdO89001 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CpdO89001 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CpdO89001 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CpdO89001 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms