Protein–RNA interactions for Protein: O88986

Gcat, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcatO88986 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GcatO88986 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GcatO88986 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GcatO88986 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GcatO88986 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GcatO88986 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GcatO88986 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GcatO88986 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GcatO88986 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GcatO88986 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GcatO88986 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GcatO88986 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GcatO88986 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GcatO88986 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GcatO88986 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GcatO88986 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GcatO88986 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GcatO88986 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GcatO88986 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GcatO88986 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GcatO88986 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GcatO88986 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GcatO88986 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GcatO88986 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GcatO88986 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GcatO88986 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GcatO88986 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GcatO88986 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GcatO88986 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GcatO88986 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GcatO88986 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GcatO88986 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GcatO88986 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GcatO88986 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GcatO88986 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GcatO88986 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GcatO88986 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GcatO88986 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GcatO88986 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GcatO88986 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GcatO88986 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GcatO88986 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GcatO88986 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GcatO88986 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GcatO88986 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GcatO88986 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GcatO88986 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GcatO88986 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GcatO88986 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GcatO88986 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GcatO88986 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GcatO88986 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GcatO88986 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GcatO88986 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GcatO88986 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GcatO88986 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GcatO88986 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GcatO88986 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GcatO88986 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GcatO88986 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GcatO88986 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GcatO88986 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GcatO88986 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GcatO88986 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GcatO88986 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GcatO88986 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GcatO88986 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GcatO88986 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GcatO88986 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GcatO88986 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GcatO88986 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GcatO88986 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GcatO88986 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GcatO88986 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GcatO88986 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GcatO88986 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GcatO88986 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GcatO88986 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GcatO88986 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GcatO88986 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GcatO88986 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GcatO88986 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GcatO88986 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GcatO88986 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GcatO88986 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GcatO88986 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GcatO88986 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GcatO88986 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GcatO88986 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GcatO88986 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GcatO88986 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GcatO88986 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GcatO88986 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GcatO88986 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GcatO88986 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GcatO88986 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GcatO88986 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GcatO88986 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GcatO88986 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GcatO88986 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms