Protein–RNA interactions for Protein: O88741

Gdap1, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdap1O88741 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdap1O88741 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gdap1O88741 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdap1O88741 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms