Protein–RNA interactions for Protein: O88513

Gmnn, Geminin, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmnnO88513 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GmnnO88513 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GmnnO88513 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GmnnO88513 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmnnO88513 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GmnnO88513 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GmnnO88513 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmnnO88513 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GmnnO88513 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GmnnO88513 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GmnnO88513 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GmnnO88513 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GmnnO88513 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GmnnO88513 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GmnnO88513 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GmnnO88513 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GmnnO88513 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GmnnO88513 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GmnnO88513 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GmnnO88513 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GmnnO88513 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GmnnO88513 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GmnnO88513 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms