Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Clec11aO88200 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clec11aO88200 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clec11aO88200 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms