Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp9aO70228 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp9aO70228 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp9aO70228 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms