Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atf5O70191 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atf5O70191 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atf5O70191 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atf5O70191 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Atf5O70191 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atf5O70191 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atf5O70191 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atf5O70191 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atf5O70191 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atf5O70191 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atf5O70191 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Atf5O70191 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf5O70191 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf5O70191 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf5O70191 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf5O70191 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf5O70191 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf5O70191 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf5O70191 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf5O70191 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf5O70191 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atf5O70191 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atf5O70191 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Atf5O70191 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atf5O70191 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf5O70191 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf5O70191 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atf5O70191 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atf5O70191 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf5O70191 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atf5O70191 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atf5O70191 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Atf5O70191 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atf5O70191 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf5O70191 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf5O70191 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms