Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx4O55187 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cbx4O55187 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx4O55187 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms