Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cyp26a1O55127 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cyp26a1O55127 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cyp26a1O55127 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cyp26a1O55127 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cyp26a1O55127 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cyp26a1O55127 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cyp26a1O55127 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp26a1O55127 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp26a1O55127 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cyp26a1O55127 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms