Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aff2O55112 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aff2O55112 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aff2O55112 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aff2O55112 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aff2O55112 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aff2O55112 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Aff2O55112 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Aff2O55112 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aff2O55112 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aff2O55112 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aff2O55112 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aff2O55112 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aff2O55112 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aff2O55112 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aff2O55112 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Aff2O55112 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Aff2O55112 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aff2O55112 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aff2O55112 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aff2O55112 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aff2O55112 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aff2O55112 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aff2O55112 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aff2O55112 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aff2O55112 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aff2O55112 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aff2O55112 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Aff2O55112 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aff2O55112 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aff2O55112 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aff2O55112 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aff2O55112 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Aff2O55112 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aff2O55112 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms