Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgals6O54891 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgals6O54891 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgals6O54891 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgals6O54891 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgals6O54891 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgals6O54891 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgals6O54891 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgals6O54891 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgals6O54891 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgals6O54891 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgals6O54891 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgals6O54891 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lgals6O54891 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgals6O54891 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms