Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EomesO54839 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EomesO54839 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EomesO54839 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EomesO54839 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EomesO54839 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EomesO54839 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EomesO54839 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EomesO54839 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EomesO54839 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EomesO54839 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EomesO54839 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EomesO54839 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EomesO54839 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EomesO54839 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EomesO54839 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EomesO54839 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EomesO54839 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EomesO54839 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EomesO54839 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EomesO54839 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EomesO54839 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EomesO54839 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EomesO54839 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EomesO54839 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EomesO54839 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EomesO54839 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EomesO54839 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EomesO54839 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EomesO54839 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EomesO54839 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EomesO54839 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EomesO54839 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EomesO54839 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EomesO54839 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EomesO54839 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EomesO54839 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EomesO54839 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EomesO54839 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EomesO54839 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EomesO54839 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EomesO54839 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EomesO54839 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EomesO54839 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EomesO54839 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EomesO54839 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EomesO54839 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EomesO54839 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EomesO54839 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EomesO54839 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EomesO54839 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EomesO54839 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EomesO54839 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EomesO54839 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EomesO54839 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EomesO54839 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EomesO54839 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EomesO54839 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EomesO54839 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EomesO54839 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EomesO54839 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EomesO54839 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EomesO54839 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EomesO54839 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EomesO54839 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EomesO54839 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EomesO54839 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EomesO54839 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EomesO54839 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EomesO54839 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EomesO54839 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EomesO54839 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EomesO54839 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EomesO54839 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EomesO54839 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EomesO54839 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EomesO54839 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EomesO54839 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EomesO54839 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EomesO54839 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EomesO54839 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EomesO54839 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EomesO54839 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EomesO54839 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EomesO54839 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EomesO54839 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EomesO54839 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EomesO54839 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EomesO54839 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EomesO54839 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EomesO54839 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EomesO54839 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EomesO54839 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EomesO54839 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EomesO54839 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EomesO54839 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EomesO54839 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EomesO54839 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EomesO54839 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EomesO54839 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms