Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpd52l1O54818 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpd52l1O54818 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpd52l1O54818 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms