Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DffaO54786 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DffaO54786 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DffaO54786 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DffaO54786 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DffaO54786 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DffaO54786 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DffaO54786 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DffaO54786 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DffaO54786 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DffaO54786 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DffaO54786 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DffaO54786 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DffaO54786 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DffaO54786 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DffaO54786 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DffaO54786 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DffaO54786 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DffaO54786 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DffaO54786 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DffaO54786 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DffaO54786 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DffaO54786 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DffaO54786 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DffaO54786 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DffaO54786 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DffaO54786 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DffaO54786 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DffaO54786 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DffaO54786 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DffaO54786 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DffaO54786 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DffaO54786 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DffaO54786 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DffaO54786 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DffaO54786 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DffaO54786 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DffaO54786 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DffaO54786 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DffaO54786 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DffaO54786 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DffaO54786 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DffaO54786 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DffaO54786 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DffaO54786 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DffaO54786 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DffaO54786 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DffaO54786 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DffaO54786 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DffaO54786 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DffaO54786 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DffaO54786 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DffaO54786 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DffaO54786 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DffaO54786 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DffaO54786 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DffaO54786 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DffaO54786 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DffaO54786 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DffaO54786 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DffaO54786 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DffaO54786 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DffaO54786 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DffaO54786 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DffaO54786 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DffaO54786 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DffaO54786 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DffaO54786 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DffaO54786 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DffaO54786 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DffaO54786 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DffaO54786 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DffaO54786 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DffaO54786 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DffaO54786 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DffaO54786 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DffaO54786 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DffaO54786 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DffaO54786 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DffaO54786 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DffaO54786 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DffaO54786 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DffaO54786 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DffaO54786 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DffaO54786 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DffaO54786 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DffaO54786 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DffaO54786 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DffaO54786 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DffaO54786 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DffaO54786 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DffaO54786 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DffaO54786 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DffaO54786 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DffaO54786 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DffaO54786 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DffaO54786 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DffaO54786 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DffaO54786 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DffaO54786 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms