Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clk2O35491 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clk2O35491 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clk2O35491 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clk2O35491 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clk2O35491 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clk2O35491 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clk2O35491 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clk2O35491 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clk2O35491 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk2O35491 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clk2O35491 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clk2O35491 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clk2O35491 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clk2O35491 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clk2O35491 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clk2O35491 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clk2O35491 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clk2O35491 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clk2O35491 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clk2O35491 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clk2O35491 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clk2O35491 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms