Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitx3O35160 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pitx3O35160 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms