Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ArxO35085 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ArxO35085 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ArxO35085 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ArxO35085 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ArxO35085 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ArxO35085 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ArxO35085 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ArxO35085 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ArxO35085 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ArxO35085 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ArxO35085 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ArxO35085 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ArxO35085 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ArxO35085 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ArxO35085 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ArxO35085 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ArxO35085 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ArxO35085 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ArxO35085 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ArxO35085 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ArxO35085 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ArxO35085 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ArxO35085 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ArxO35085 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ArxO35085 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ArxO35085 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ArxO35085 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ArxO35085 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ArxO35085 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ArxO35085 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ArxO35085 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ArxO35085 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ArxO35085 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ArxO35085 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ArxO35085 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ArxO35085 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ArxO35085 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ArxO35085 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ArxO35085 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ArxO35085 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ArxO35085 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ArxO35085 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ArxO35085 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ArxO35085 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ArxO35085 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ArxO35085 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ArxO35085 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ArxO35085 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ArxO35085 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ArxO35085 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ArxO35085 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ArxO35085 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ArxO35085 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ArxO35085 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ArxO35085 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ArxO35085 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ArxO35085 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ArxO35085 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ArxO35085 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ArxO35085 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ArxO35085 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ArxO35085 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ArxO35085 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ArxO35085 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ArxO35085 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ArxO35085 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ArxO35085 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ArxO35085 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ArxO35085 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ArxO35085 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ArxO35085 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ArxO35085 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ArxO35085 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ArxO35085 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ArxO35085 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ArxO35085 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ArxO35085 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ArxO35085 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ArxO35085 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ArxO35085 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ArxO35085 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ArxO35085 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ArxO35085 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ArxO35085 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ArxO35085 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ArxO35085 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ArxO35085 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ArxO35085 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ArxO35085 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ArxO35085 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ArxO35085 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ArxO35085 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ArxO35085 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ArxO35085 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ArxO35085 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ArxO35085 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ArxO35085 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ArxO35085 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ArxO35085 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms