Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtgisO35074 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtgisO35074 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtgisO35074 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtgisO35074 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtgisO35074 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtgisO35074 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtgisO35074 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PtgisO35074 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtgisO35074 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtgisO35074 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PtgisO35074 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtgisO35074 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms