Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac1O09106 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac1O09106 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Hdac1O09106 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac1O09106 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac1O09106 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac1O09106 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac1O09106 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac1O09106 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.3 ms