Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm3488M0QW81 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3488M0QW81 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3488M0QW81 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms