Protein–RNA interactions for Protein: L7N479

Tcrg-C3, T cell receptor gamma, constant 3, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C3L7N479 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcrg-C3L7N479 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcrg-C3L7N479 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-C3L7N479 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms