Protein–RNA interactions for Protein: L7N280

Gm21962, Predicted gene, 21962, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21962L7N280 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21962L7N280 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm21962L7N280 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm21962L7N280 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm21962L7N280 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm21962L7N280 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms