Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21887J3QQ04 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms