Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm21969J3QJZ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm21969J3QJZ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm21969J3QJZ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm21969J3QJZ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm21969J3QJZ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm21969J3QJZ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm21969J3QJZ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm21969J3QJZ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm21969J3QJZ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms