Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r12G5E8G1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r12G5E8G1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r12G5E8G1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms