Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hmgxb3G3X9M3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms