Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm16519F8VQK7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm16519F8VQK7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.1 ms