Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Srp72F8VQC1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srp72F8VQC1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1409.4 ms