Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3371F7CQW8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3371F7CQW8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3371F7CQW8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3371F7CQW8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms