Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arl9F7BE40 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arl9F7BE40 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Arl9F7BE40 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arl9F7BE40 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl9F7BE40 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms