Protein–RNA interactions for Protein: F6XDR3

Gm10542, Predicted gene 10542, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10542F6XDR3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10542F6XDR3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10542F6XDR3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10542F6XDR3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10542F6XDR3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10542F6XDR3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10542F6XDR3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10542F6XDR3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10542F6XDR3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10542F6XDR3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10542F6XDR3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10542F6XDR3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10542F6XDR3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10542F6XDR3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10542F6XDR3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10542F6XDR3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms