Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm28305F6U473 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms