Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm29094F6Q785 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm29094F6Q785 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm29094F6Q785 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm29094F6Q785 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms