Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col22a1E9Q7P1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col22a1E9Q7P1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col22a1E9Q7P1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col22a1E9Q7P1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col22a1E9Q7P1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col22a1E9Q7P1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col22a1E9Q7P1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col22a1E9Q7P1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col22a1E9Q7P1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col22a1E9Q7P1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col22a1E9Q7P1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Col22a1E9Q7P1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Col22a1E9Q7P1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col22a1E9Q7P1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Col22a1E9Q7P1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Col22a1E9Q7P1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col22a1E9Q7P1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col22a1E9Q7P1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Col22a1E9Q7P1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col22a1E9Q7P1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col22a1E9Q7P1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col22a1E9Q7P1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col22a1E9Q7P1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Col22a1E9Q7P1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col22a1E9Q7P1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col22a1E9Q7P1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms