Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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