Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph10bE9PYQ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph10bE9PYQ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph10bE9PYQ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms