Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc78D3Z5T1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc78D3Z5T1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc78D3Z5T1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms