Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Gm20521D3Z5F7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Gm20521D3Z5F7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gm20521D3Z5F7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gm20521D3Z5F7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms